From 05d8c44a445a167d9524c3c77b337fded0230424 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: =?UTF-8?q?Dar=C3=ADo=20Here=C3=B1=C3=BA?= Date: Sat, 18 May 2024 00:27:09 -0300 Subject: [PATCH] bwa: add Spanish translation (#12794) --- pages.es/linux/bwa.md | 25 +++++++++++++++++++++++++ 1 file changed, 25 insertions(+) create mode 100644 pages.es/linux/bwa.md diff --git a/pages.es/linux/bwa.md b/pages.es/linux/bwa.md new file mode 100644 index 000000000..0e155d04b --- /dev/null +++ b/pages.es/linux/bwa.md @@ -0,0 +1,25 @@ +# bwa + +> Herramienta de alineación Burrows-Wheeler. +> Mapeador de secuencias de ADN cortas y poco divergentes frente a un gran genoma de referencia, como el genoma humano. +> Más información: . + +- Indexa el genoma de referencia: + +`bwa index {{ruta/a/referencia.fa}}` + +- Mapea las lecturas de un solo extremo (secuencias) al genoma indexado utilizando 32 subprocesos y comprime el resultado para ahorrar espacio: + +`bwa mem -t 32 {{ruta/a/referencia.fa}} {{ruta/a/lectura_solo_extremo.fq.gz}} | gzip > {{ruta/a/alineamiento_solo_extremo.sam.gz}}` + +- Mapea las lecturas del par final (secuencias) al genoma indexado usando 32 subprocesos y comprime el resultado para ahorrar espacio: + +`bwa mem -t 32 {{ruta/a/referencia.fa}} {{ruta/a/lectura_par_final_1.fq.gz}} {{ruta/a/lectura_par_final_2.fq.gz}} | gzip > {{ruta/a/alineamiento_par_final.sam.gz}}` + +- Mapea las lecturas del par final (secuencias) al genoma indexado usando 32 subprocesos con [M]arcadores divididos más cortos como secundarios para la compatibilidad del archivo SAM de salida con el software Picard y luego comprime el resultado: + +`bwa mem -M -t 32 {{ruta/a/referencia.fa}} {{ruta/a/lectura_par_final_1.fq.gz}} {{ruta/a/lectura_par_final_2.fq.gz}} | gzip > {{ruta/a/alineamiento_par_final.sam.gz}}` + +- Mapea las lecturas finales del par (secuencias) al genoma indexado usando 32 subprocesos con [C]omentarios FASTA/Q (p. ej. BC:Z:CGTAC) anexando a un resultado comprimido: + +`bwa mem -C -t 32 {{ruta/a/referencia.fa}} {{ruta/a/lectura_par_final_1.fq.gz}} {{ruta/a/lectura_par_final_2.fq.gz}} | gzip > {{ruta/a/lectura_par_final.sam.gz}}`