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snakefmt

Formata arquivos Snakemake. Mais informações: https://github.com/snakemake/snakefmt.

  • Formata um Snakefile específico:

snakefmt {{caminho/para/snakefile}}

  • Formata todos os Snakefiles recursivamente em uma pasta específica:

snakefmt {{caminho/para/diretorio}}

  • Formata um arquivo usando um arquivo de configuração específico:

snakefmt --config {{caminho/para/config.toml}} {{caminho/para/snakefile}}

  • Formata um arquivo usando um comprimento máximo de linha específico:

snakefmt --line-length {{100}} {{caminho/para/snakefile}}

  • Exibe às mudanças que seriam realizadas sem realiza-las:

snakefmt --diff {{caminho/para/snakefile}}